L'atoll Johnston est un atoll de l'océan Pacifique Nord situé à 1 328 km d'Honolulu (Hawaii). Découvert officiellement en 1807 par le capitaine Charles James Johnston, les quatre îles qui le composent ont été revendiquées par les États-Unis et le royaume de Hawaii en 1858 mais suivant le Guano Islands Act, ce sont les États-Unis qui commencèrent à exploiter les gisements de guano jusqu'à leur épuisement à la fin des années 1880.

L'atoll Johnston a été désigné réserve naturelle en 1926. La marine américaine en reçut le contrôle en 1934, relayée en 1948 par l'US Air Force.

L'atoll a été le site d'essais nucléaires dans les années 1960 et jusque dans les années 2000 l'atoll est resté un site de stockage d'armes chimiques, aujourd'hui détruites. Cette destruction a été réalisée par une usine, la Johnston Atoll Chemical Agent Disposal System (JACADS), construite sur l'île à la fin des années 1980 et démontée en 2003 une fois la tâche finie.

Jusqu'alors occupée par environ 310 militaires, toutes les installations sont démontées en 2003 et l'île abandonnée.

L'atoll Johnston fait partie des îles mineures éloignées des États-Unis et il est inclus dans une zone classé Pacific Remote Islands Marine National Monument depuis le 6 janvier 2009.

Le drapeau, souvent associé à l'atoll mais sans aucune valeur légale, a été choisi à la suite d'un concours avec un vote ouvert aux 1200 résidents.